Цветки пенстемона уиппленуса окрашены в особенно насыщенный красновато-фиолетовый оттенок и собраны в соцветия на верхушке стебля и в нескольких верхних листовых узлах. Иногда венчик может быть бледно-голубым или белым. Цветки в каждом соцветии расположены кольцом, направлены во все стороны, слегка наклонены вниз. Цветки, длинные тонкие листовые прицветники снизу и верхняя часть стебля покрыты короткими железистыми волосками, а нижняя часть стебля гладкая и безволосая. Более длинные волоски находятся на внутренней стороне нижней трехлопастной губы, которая выступает вперед и не сильно загибается назад. Верхняя губа слегка изгибается вверх.